Seminar: Systembiologie

DozentFinja Büchel, Clemens Wrzodek, Dr. Andreas Dräger, Roland Keller
Sprechstunde nach Vereinbarung
Zeit Donnerstags 13-14 Uhr
Credit points, Diplom 2 SWS
Credit points, Master 4 LP
Beginn 10. November 2011
Vorbesprechung 12. Oktober 2011, um 17 Uhr
Ort Raum A302, Sand 13
Turnus regelmäßig

Beschreibung

In den letzten Jahren hat sich der junge Wissenschaftszweig der Systembiologie rapide entwickelt. In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsthemen aus diesem interdisziplinären Fachgebiet behandelt. Neben Themen zur Modellierung und Rekonstruktion regulatorischer und metabolischer Netzwerke werden unter anderem moderne Messmethoden sowie ausgewählte und weit verbreitete Software-Tools vorgestellt. Teilnehmende halten ein Referat auf Deutsch oder Englisch (45 min + 15 min Diskussion) und erstellen eine schriftliche Ausarbeitung (ca. 15 bis 20 Seiten entsprechend der unten angegebenen Stilvorlage).

Themen

Datum Thema Betreuung Referent(in)
10.11.2011 Hochdurchsatzmessungen 1: Microarrays and low-level data processing [1,2] Clemens Wrzodek André Hennig
17.11.2011 Gene set enrichment analysis[3] Clemens Wrzodek Immanuel Luhn
24.11.2011 Die KEGG-Bioinformatik-Datenbank und pathway-Analysen: KEGG, KEGGtranslator und SubpathwayMiner [4-6] Dr. Andreas Dräger Andreas Zink
01.12.2011 Vorhersage und Visualisierung von Proteininteraktionsnetzwerken [7,8] Finja Büchel Alexander Peltzer
08.12.2011 Inferenz genregulatorischer Module [9,10] Roland Keller Julia Soellner
15.12.2011 Next-Generation DNA Sequencing Methods [11,12] Roland Keller Evelina Pillai
12.01.2012 Modellierung mit SBML und Flussbilanzanalysen [15,16] Dr. Andreas Dräger Julianus Pfeuffer
19.01.2012 Micro RNAs: Funktion und Target-Vorhersage [17] Clemens Wrzodek Julian Gutekunst
26.01.2012 Genomweite Assoziationsanalysen [18,19] Finja Büchel Dilek Tuncbilek
02.02.2012 Nachbesprechung Dozenten

Stilvorlage
  • Für die Erstellung der Ausarbeitungmit Word97/2000 gibt es hier eine Stilvorlage( Word97-Format, 27kB).
  • Wenn Sie eine andere Textverarbeitungbevorzugen, orientieren Sie sich bitte an diesem Muster ( PDF-Format, 13kB).
  • Für Latex-Fans gibt es einen Stylemit kleinem Demo.
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[2] Allison, D. B., Cui, X., Page, G. P. & Sabripour, M. Microarray data analysis: from disarray to consolidation and consensus. Nat Rev Genet 7, 55-65 (2006).
[3] Subramanian, A.; Tamayo, P.; Mootha, V. K.; Mukherjee, S.; Ebert, B. L.; Gillette, M. A.; Paulovich, A.; Pomeroy, S. L.; Golub, T. R.; Lander, E. S. & Mesirov, J. P. Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proc Natl Acad Sci U S A, Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard, 320 Charles Street, Cambridge, MA 02141, USA., 2005, 102, 15545-15550
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