Seminar: Algorithmen zum Wirkstoffdesign

Beschreibung:
Es werden aktuelle Algorithmen zum Wirkstoffdesign behandelt.  Desweiteren wird zur Ergänzung das Seminar 'Machine Learning' empfohlen.

Teilnehmende halten ein Referat (45min Referat + 15min Diskussion) mit Folien oder Laptop-Projektion und erstellen eine schriftliche Ausarbeitung (ca. 15-20 Seiten entsprechend der unten angegebenen Stilvorlage). 

Themen und Termine

Datum	Thema	Betreuung	Referent(in)
06.11.2003	Einführung: Wirkstoffdesign	Jörg Wegner	Jörg Wegner
13.11.2003	Ringsuche: SSSR, ESER, ESSR, GSCE	Jörg Wegner	Christoph Gattnar
20.11.2003	Maximum Common Substructures (MCS) and Pharmacophores	Jörg Wegner	Birgit Miesner
27.11.2003	Clustering algorithms (Overview)	Jörg Wegner	Matthias Zschunke
04.12.2003	Fuzzy Clustering	Jörg Wegner	Roland Pache
11.12.2003	D-optimal design, Statistical Molecular Design (SMD)	Jörg Wegner	Cornelia Friedle
18.12.2003	Regression and Classification models: Decision Forrests, SVM, Consensus models	Jörg Wegner	Stephan Symons
08.01.2004	Combinatorial Optimization using Tabu search	Jörg Wegner	Marc Lohrer
15.01.2004	Optimization using Evolutionary Algorithms (EA)	Jörg Wegner	Nikolas Fechner
22.01.2004 (Doppeltermin)	Multiobjective Optimization	Jörg Wegner	Georg Hinselmann
22.01.2004 (Doppeltermin)	Codierung von Deskriptoren: Autokorrelation, RDF, FFT, Wavlets	Jörg Wegner	Nikita Meyer
29.01.2004 (Doppeltermin)	De Novo Design + Chemical Constraints	Jörg Wegner	Verena Schattel
29.01.2004 (Doppeltermin)	Konformationsanalyse + Ligand-Protein-Docking	Jörg Wegner	Christoph Wilke

Anmeldung:
Ausschließlich über dieses Webformular. Tragen Sie sich bitte selbst mit den Schaltflächen ganz rechts in der Termin-Tabelle ein. Wir reservieren Ihnen dann das gewünschte Thema bis zur Vorbesprechung, an der Sie persönlich anwesend sein müssen.
Falls Sie eine Anmeldung wieder streichen möchten, schicken Sie bitte eine entsprechende Email mit Ihrem Namen, Titel des Seminars und Vortrags sowie Ihrer Matrikelnummer an Felix Streichert.

Voraussetzungen:
ab 5. Semester 

Literatur:
 - Journal-Publikationen:
   -- CAS Service (Naturwissenschaften, Schwerpunkt: Chemie, Biologie, Medizin, Physik)
   -- CiteSeer (Informatik)
   -- und ausgeteilte Literatur
 - Vorlesungen:
   -- H. Kubinyi: Drug Design [Kubinyi] (http://home.t-online.de/home/kubinyi/lectures.html)
 - Bücher:
   -- Böhm, Klebe, Kubinji: Wirkstoffdesign, Spektrum Akad. Verlag, 1996 [BKK]
   -- Todeschini, Consonni: Handbook of Molecular Descriptors, Wiley-VCH, 2000 [TC]
   -- Clark: Evolutionary Algorithms in Molecular Design, Wiley-VCH, 2000 [Clark]

Bemerkungen: 
Besonders geeignet für Studierende der Bioinformatik. 

Stilvorlage

• Für die Erstellung der Ausarbeitung mit Word97/2000 gibt es hier eine Stilvorlage (, 27kB).
• Wenn Sie eine andere Textverarbeitung bevorzugen, orientieren Sie sich bitte an diesem Muster (, 13kB).
• Für -Fans gibt es seit kurzem einen Style mit kleinem Demo.