University of Tübingen: Prakt.: Chemoinformatik

Computer Architecture

Teaching

Prakt.: Chemoinformatik

	Prosem.: Artificial Life
	Basisprakt.: Mobile Roboter
	Genetische Algorithmen und Evolutionsstrategien
	Neuronale Netze
	Robotik II
	Chemieinformatik
	Sem.: Inference of Regulatory and Metabolic Networks
	Sem.: Kernel Methods in Machine Learning
	Prakt.: Evolutionäre Algorithmen
	Prakt.: Chemoinformatik
	Prakt.: Data Mining in der Systembiologie

Computer Science Dept.

University of Tübingen

Praktikum: Chemoinformatik

Dozent	Nikolas Fechner, Georg Hinselmann
Sprechstunde	während des Praktikums und n.V.
Zeit	Mi 14-18 Uhr
Umfang	4 SWS
Beginn	18. April 2007
Vorbesprechung und Einführung	18. April 2007 Anwesenheitspflicht!
Ort	wird noch festgelegt
Turnus	unregelmäßig

Beschreibung: In diesem Praktikum sollen anhand einer praxisnahen Aufgabenstellung Methoden aus der Chemoinformatik kennengelernt werden. Die grundlegende Aufgabenstellung ist die Identifizierung einer (neuen) Leitstruktur für ein vorgegebenes Target. Als Datenbasis werden bekannte Liganden mit gemessenen Affinitäten und zu einem späteren Zeitpunkt die 3D Struktur des Targets verwendet.

Um die Aufgabe zu lösen werden verschiedene konzeptionelle Ansätze (QSAR, Data Mining, kombinatorische Synthese, Virtual Screening, Docking, ...) und Software-Pakete (JOELib2, WEKA, LibSVM, JavaEvA, Schrödinger Suite 2006) verwendet.

Vorkenntnisse in den Bereichen Chemoinformatik und Maschinellem Lernen sind von Vorteil. Gute Java Kenntnisse werden vorausgesetzt.

Teilnehmerliste:

Literatur:

Last changes: 19.03.2018, 18:46 CET. RA-Webmaster.

Impressum