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Computer Science Dept.
University of Tübingen
 
 

Grundlagen der Chemieinformatik

Dozent Dr. Christoph Steinbeck
Sprechstunde nach Vereinbarung
Zeit Mittwoch 10-12 Uhr ct.
Umfang 2V+1Ü
Beginn 25.04.2007
Ort A302
Turnus unregelmäßig
Prüfungsfach

Übungen zu dieser Vorlesung

Beschreibung:
Chemieinformatik ist addressiert und löst Probleme in der Chemie mit Methoden der Informatik. Anwendung findet dies in allen chemiespezifischen Computerprogrammen - in Moleküleditoren, chemischen Datenbanken und Programmen zur Vorhersage von Struktureigenschaften. Der Prozess der pharmazeutischen Wirkstoffsuche ist heute ohne chemoinformatische Unterstützung nicht mehr denkbar. Die Vorlesung wird eine Einführung in die Grundlagen der Chemoinformatik anbieten. Wir behandeln:

  • Was ist Chemieinformatik und wo findet sie ihre Anwendung
  • Codierung und Speicherung chemischer Strukturen
  • Visualisierung in 2D und 3D
  • Anwendung chemischer Graphentheorie:
    • Ringsuchen
    • Aromatizitätsdetektion
    • Substruktursuchen
  • Deskriptoren und QSAR
  • Strukturgeneratoren
  • Automatische Strukturaufklärung
  • Chemische Datenbanken: Anwendungen und Suchen
  • Chemische Reaktionen: Representation, Vorhersage, Datenbanken

Voraussetzungen:
Vordiplom erwünscht (aber nicht Bedingung), Java-Programmierkenntnisse

Literatur:
Chemoinformatics. A Textbook (Gebundene Ausgabe)
von Johann Gasteiger und Thomas Engel
680 Seiten, Wiley-VCH; Auflage: 1 (Oktober 2003)
ISBN-10: 3527306811
ISBN-13: 978-3527306817

Vorlesungsfolien (nur intern verfügbar):
Vorlesung 1, Vorlesung 2, Vorlesung 3, Vorlesung 4, Vorlesung 5, Vorlesung 6, Vorlesung 7, Vorlesung 8, Vorlesung 9, Vorlesung 10


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