Proseminar: Algorithmen zum Wirkstoffdesign

Beschreibung:

Es werden unterschiedliche Themengebiete des rechnergestützten Wirkstoffdesigns (Structure Based Drug Design, SBDD) behandelt. 

Themen und Termine

Datum	Thema	Betreuung	Referent(in)
29.04.2004	Vorbesprechung und Übersichtsvortrag: Relevanz des Wirkstoffdesigns	Jörg Wegner	Jörg Wegner
01.07.2004	Beschreibung molekularer Strukturen: Deskriptoren [TC]	Jörg Wegner	Nico Weber
01.07.2004	Hypothesen: Modellqualität, Merkmalsselektion (feature selection) und Modelltypen (Teil 1)	Jörg Wegner	Michael Hitzelberger
08.07.2004	Pharmakokinetik (ADME)+Modelltypen (Teil 2)	Jörg Wegner	Maria Krügle
08.07.2004	Screening: Knock-Out Filter-Kriterien und Ähnlichkeitsanalysen	Jörg Wegner	Sabine Reusing
15.07.2004	Bioisosteroismus/Pharmakophore: Suche nach grössten gemeinsamen Substrukturen in Molekülen	Jörg Wegner	Matthias Sohr
15.07.2004	Computer-Assisted Structure Elucidation (CASE)	Jörg Wegner	Antonios Ntefeloudis
22.07.2004	Bibliotheksdesign: Algorithmen der kombinatorischen Chemie [BKK 11]	Jörg Wegner	Stephanie Gursch
22.07.2004	Homologiemodelle (Proteine) und De Novo Design (Liganden)	Jörg Wegner	Josia Assmies
	Evolutionäre Algorithmen im Wirkstoffdesign: Einleitung und Übersicht [Clark]		-

Teilnehmende halten ein Referat (45min Referat + 15min Diskussion) mit Folien oder Laptop-Projektion und erstellen eine schriftliche Ausarbeitung (ca. 12-15 Seiten entsprechend der unten angegebenen Stilvorlage).

Voraussetzungen:
keine 

Literatur:
 - Journal-Publikationen:
   -- CAS Service (Naturwissenschaften, Schwerpunkt: Chemie, Biologie, Medizin, Physik)
   -- CiteSeer (Informatik)
   -- und ausgeteilte Literatur
 - Vorlesungen:
   -- H. Kubinyi: Drug Design [Kubinyi] (http://home.t-online.de/home/kubinyi/lectures.html)
 - Bücher:
   -- Böhm, Klebe, Kubinji: Wirkstoffdesign, Spektrum Akad. Verlag, 1996 [BKK]
   -- Todeschini, Consonni: Handbook of Molecular Descriptors, Wiley-VCH, 2000 [TC]
   -- Clark: Evolutionary Algorithms in Molecular Design, Wiley-VCH, 2000 [Clark]

Bemerkungen:  Besonders geeignet für Studierende der Bioinformatik. Die TeilnehmerInnen werden gebeten sich möglichst noch in der vorlesungsfreien Zeit beim Betreuer zu melden, um bereits (englische!) Literatur zum Thema zu erhalten.

Stilvorlage
Für die Erstellung der Ausarbeitung mit Word97 gibt es hier eine Stilvorlage. Damit Sie sich ein Bild davon machen können, wie eine fertige, gelungene Ausarbeitung aussehen könnte, bieten wir Ihnen eine Arbeit aus dem letzten Semester von Thomas Schurtz zum Thema "Java3D, VRML und Web3D" (, 91kB) an.