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Computer Science Dept.
University of Tübingen
 
 

Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche

Dozent Prof. Dr. A. Zell, J. Wegner
Sprechstunde während des Praktikums und n.V.
Zeit Do., 15 bis 19 Uhr
Umfang 4
Beginn Do., 08.05.2003, 15.c.t.
Vorbesprechung Do., 08.05.2003, 15.c.t.
Ort Raum A 307, Sand 1
Turnus unregelmäßig

Beschreibung:
Praktikumsteilnehmer bearbeiten je nach Schwierigkeitsgrad der Aufgaben einzeln oder in Kleingruppen (2-3 Teilnehmer) aktuelle Fragestellungen der rechnergestützten Wirkstoffsuche. Hierbei werden vor allem die Software-Bibliothek JOELib (Uni Tübingen), JCompChem (Uni Tübingen) und MOE (Chemical Computing Group) eingesetzt. Mögliche Themen:
1. Methoden des Molecular Modeling
2. Konformationsanalyse
3. Algorithmen der kombinatorischen Chemie
4. Fingerprint-Deskriptoren zur Leitstruktursuche
5. Topologische Deskriptoren zur Suche von Leitstrukturen
6. Räumliche Deskriptoren zur Suche von Leitstrukturen
7 . Anwendungen künstlicher neuronaler Netze im Wirkstoffdesign
8. Simulation pharmakokinetischer Vorgänge
9. Quantitative Struktur-Wirkungsbeziehungen (QSAR)
10. 3D-Struktur-Wirkungsbeziehungen, CoMFA-Methode

Termine:
werden noch bekannt gegeben


Datum Thema Betreuung Referent(in)
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner Christoph  Wilke
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner Nadja Betzler
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner -
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner Hedwig Zimmerer
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner Nikita Meyer
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner Sandra Haupt
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner Magdalena Feldhahn
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner Lisa Peltason
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner Adrian Schröder
01.04.2003 Praktikum: Rechnergestützte Wirkstoffsuche Jörg K. Wegner Munir Khleif


Voraussetzungen:
nur geeignet für Bioinformatiker oder Informatiker mit NF Chemie. Java-Kenntnisse sind sinnvoll.

Literatur: 
Böhm, Klebe, Kubinji: Wirkstoffdesign, Spektrum Akad. Verlag.
verschiedene Journal-Artikel.

Bemerkungen: 
Der Besuch der einstündigen Vorlesung "Arzneistoffdesign" wird empfohlen. 


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