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Seminar: Microarrays und Genexpression

Dozent Dr. K. Nieselt-Struwe
Sprechstunde nach dem Seminar vor Ort und n.V.
Zeit Do. 9:00 s.t.-10:00
Umfang
Beginn 18.04.2002
Vorbesprechung Do., 18.04.2002, 9 Uhr (s.t.), A302 Sand 1
Ort A302 Sand 1
Turnus unregelmäßig 

Beschreibung:
In diesem Seminar wollen wir uns mit den Grundlagen und bisherigen Forschungserrungenschaften der Microarray- bzw. DNA-Chip-Technologie aber auch anderen Verfahren zur Expressionsanalyse befassen.

Die Themen des Seminars sind aktuelle Forschungsarbeiten aus folgenden Bereichen:

Grundlagen von Microarray-Technologien
Spoterkennung,Gridding,Bildanalyse
Analysemethoden von Microarray-Experimenten
Standardisierungen der Microarray-Technologien
Datenbankimplementierungen
Algorithmen zur Clusterung, Signifikanz ...
Weitere Expressionsverfahren und ihre algorithmischen Implementierungen

Teilnehmende halten ein Referat (45min + 10min Diskussion) mit Folien oder Laptop-Projektion und erstellen eine schriftliche Ausarbeitung (ca. 12-15 Seiten, A4, einspaltig, 12pt Times, 2.5cm Rand). 

Dieses Seminar richtet sich nicht nur an Bioinformatik-Studierende, sondern auch an Studierende der Biologie mit Interesse an diesem in der Biologie so aktuellen Gebiet.

Neu: Die Anmeldung zum Seminar ist geschlossen.

Themen und Termine
Datum Thema Betreuung Referent(in)
25.04.2002 Serial Analysis of Gene expression (SAGE) Stephan Steigele Katharina Anna Lehmann
02.05.2002 Einführung in die cDNA microarray-Technologie Kay Nieselt-Struwe Nils Krugmann
16.05.2002 Einführung in die oligo-basierte microarray-Technologie Kay Nieselt-Struwe Jörg Behrend
23.05.2002 Low-Level Datenanalyse: Spoterkennung, Gridding, Fehlerbehandlung Kay Nieselt-Struwe Tobias Thierer
30.05.2002 Überblick über Prinzipien der Expressionsanalyse Kay Nieselt-Struwe Florian Sieker
06.06.2002 Clusterung von Expressionsprofilen (Hierarchical, graphical, ...) Kay Nieselt-Struwe Nora Pierstorff
13.06.2002 Analyse von Expressionsdaten mit "self organizing maps, neural networks, principle components" Kay Nieselt-Struwe Rudolf Koopmann
20.06.2002 Bemühungen zu Standardisierungen, Datenbanken, ... Janko Dietzsch Claas Eggert
- Supervised Learning: Support vector Machines Janko Dietzsch
04.07.2002 Experimentelle Anwendungen von microarrays (neue Gene, Zellzyklus, Krebsdiagnostik, ...) Stephan Steigele Stephan Waldert
11.07.2002 Proteinarrays Kay Nieselt-Struwe Andreas Bartelt
  Warteliste  

Anmeldung:
Ausschließlich über dieses Webformular. Tragen Sie sich bitte selbst mit den Schaltflächen ganz rechts in der Termin-Tabelle ein (die Tabelle wird demnächst ins Netz gestellt). Wir reservieren Ihnen dann das gewünschte Thema bis zur Vorbesprechung, bei der Sie persönlich anwesend sein müssen.
Falls Sie eine Anmeldung wieder streichen möchten, schicken Sie bitte eine entsprechende Email mit Ihrem Namen, Titel des Seminars und Vortrags sowie Ihrer Matrikelnummer an Ralf Tetzlaff.

Voraussetzungen:
ab 5. Semester 

Literatur: 
Aktuelle Veröffentlichungen, die von der Dozentin zur Verfügung gestellt werden.

Bemerkungen: 

Stilvorlage
Für die Erstellung der Ausarbeitung mit Word97 gibt es hier eine Stilvorlage.


Letzte Änderung: 20.02.2008, 10:58 CET. RA-Webmaster.
http://www.ra.cs.uni-tuebingen.de/lehre/ss02/sem_microarrays.html
© 2002 Universität Tübingen